B1	B2	KR	REQ	REFERENCE
C	C2	317.0000	1.5220	"GLY,ASP,GLU"
C	C3	317.0000	1.5220	END
C	CA	469.0000	1.4000	TYR
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C	CD	469.0000	1.4000	TYR
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C	CM	410.0000	1.4440	THY
C	CT	317.0000	1.5220	
C	JB	447.0000	1.4190	GUA
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C	JJ	410.0000	1.4440	URA
C	JQ	317.0000	1.5220	"GLY,ASP,GLU  OPLS (JTR 12-11-85)"
C	JV	317.0000	1.5220	END   OPLS (JTR 12-11-85)
C	JW	317.0000	1.5220	END   OPLS (JTR 12-11-85)
C	JZ	317.0000	1.5220	"AA, OPLS  (JTR 12/11/85)"
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C2	JC	317.0000	1.5040	HIS
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C2	JQ	260.0000	1.5260	AA(OL) OPLS (JTR 12-11-85)
C2	JV	260.0000	1.5260	ILE(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
C2	JW	260.0000	1.5260	ILE(OL) OPLS (JTR 12-11-85)
C2	JZ	260.0000	1.5260	"AA,SUG   OPLS (JTR 12/11/85)"
C2	N	337.0000	1.4490	GLY(OL)
C2	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)
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C3	JQ	260.0000	1.5260	ILE(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
C3	JZ	260.0000	1.5260	ALA   OPLS (JTR 12/11/85)
C3	N	337.0000	1.4490	TEST!!!!
C3	N*	337.0000	1.4750	9 methyl bases
C3	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)
C3	N3	367.0000	1.4710	
C3	OH	386.0000	1.4250	"SUG(OL),SER"
C3	OS	320.0000	1.4250	DMP
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C3	SH	222.0000	1.8100	CYS(OL)
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CC	NB	410.0000	1.3940	"ADE,GUA,HIS"
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CG	NA	427.0000	1.3810	"TRP,HIS"
CH	CH	260.0000	1.5260	"SUG(as in CH-C2),ILE"
CH	JQ	260.0000	1.5260	"AA,SUG  OPLS (JTR 12-11-85)"
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CH	JW	260.0000	1.5260	ALA  OPLS (JTR 12-11-85)
CH	JZ	260.0000	1.5260	"SUG(as in CH-C2),ILE  OPLS (JTR 12/11/85)"
CH	N	337.0000	1.4490	AA
CH	N*	337.0000	1.4750	"ADE,GUA,CYT,URA"
CH	N3	367.0000	1.4710	LYS(OL)
CH	NT	367.0000	1.4710	AA
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CH	OS	320.0000	1.4250	SUG
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CJ	CM	549.0000	1.3500	THY
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CK	N*	440.0000	1.3710	
CK	NB	529.0000	1.3040	
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CM	HC	340.0000	1.0800	
CM	JV	317.0000	1.5100	THY(use std C-C)
CM	JW	317.0000	1.5100	THY(use std C-C)
CM	N*	448.0000	1.3650	
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CQ	NC	502.0000	1.3240	
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CR	NA	477.0000	1.3430	HIS
CR	NB	488.0000	1.3350	HIS(MOD)
CT	CT	310.0000	1.5260	
CT	HC	331.0000	1.0900	
CT	N	337.0000	1.4490	
CT	N*	337.0000	1.4750	
CT	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)
CT	N3	367.0000	1.4710	LYS(OL)
CT	OH	320.0000	1.4100	
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CT	S	222.0000	1.8100	CYX(OL)
CT	SH	222.0000	1.8100	CYS(OL)
CV	HC	340.0000	1.0800	
CV	NB	410.0000	1.3940	"ADE,GUA,HIS"
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FE	NP	70.0000	2.0000	HEME
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H	N2	434.0000	1.0100	"URA,GUA,HIS"
H	NA	434.0000	1.0100	"URA,GUA,HIS"
H2	N	434.0000	1.0100	AA
H2	N2	434.0000	1.0100	"ADE,GUA,CYT,GLN,ASN,ARG"
H2	NT	434.0000	1.0100	AA(END)
H3	N2	434.0000	1.0100	"ADE,GUA,CYT,GLN,ASN,ARG"
H3	N3	434.0000	1.0100	LYS(OL)
H4	O4	6000.0000	0.9572	TIP4P MODEL OPLS (JTR 12-11-85)
HO	OH	553.0000	0.9600	SUG(OL)
HO	OS	553.0000	0.9600	SUG(OL)
HS	SH	274.0000	1.3360	CYS(OL)
HT	HT	6000.0000	1.5174	TIP3P MODEL OPLS (JTR  3-19-85)
HT	OT	6000.0000	0.9572	TIP3P MODEL OPLS (JTR 12-11-85)
HW	HW	553.0000	1.5136	
HW	OW	553.0000	0.9572	
J*	C2	317.0000	1.4950	TRP(OL)
J*	JB	388.0000	1.4590	TRP
J*	JG	546.0000	1.3520	TRP
J*	JQ	317.0000	1.4950	TRP(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
J4	N2	481.0000	1.3400	ARG  OPLS (JTR 09-22-86)
JA	JB	469.0000	1.4040	ADE
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JA	JJ	427.0000	1.4330	CYT
JA	JK	469.0000	1.4000	"PHE,TYR OPLS (JTR 6-29-89)"
JA	JQ	317.0000	1.5100	"PHE,TYR  OPLS (JTR 12-11-85)"
JA	N2	481.0000	1.3400	ARG
JA	NA	427.0000	1.3810	GUA
JA	NC	483.0000	1.3390	"ADE,GUA,CYT"
JA	OH	450.0000	1.3640	TYR OPLS (JTR 10-25-86)
JB	JB	520.0000	1.3700	"ADE,GUA"
JB	JC	460.0000	1.4400	HEME
JB	JD	469.0000	1.4000	TRP
JB	JK	388.0000	1.4590	TRP OPLS (JTR 10-22-90)
JB	JN	447.0000	1.4190	TRP
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JB	JV	300.0000	1.5100	HEME      OPLS (JTR 12-11-85)
JB	JW	300.0000	1.5100	HEME      OPLS (JTR 12-11-85)
JB	JY	450.0000	1.5100	HEME
JB	N*	436.0000	1.3740	"ADE,GUA"
JB	NB	414.0000	1.3910	"ADE,GUA,HIS"
JB	NC	461.0000	1.3540	"ADE,GUA"
JC	JD	250.0000	1.4000	HEME
JC	JF	512.0000	1.3750	HIS
JC	JG	518.0000	1.3710	HIS
JC	JQ	317.0000	1.5040	HIS   OPLS (JTR 12-11-85)
JC	NA	422.0000	1.3850	HIS
JC	NB	410.0000	1.3940	"ADE,GUA,HIS"
JC	NO	180.0000	1.3800	HEME
JC	NP	180.0000	1.3800	HEME
JD	JD	469.0000	1.4000	"TRP,TYR,PHE"
JD	JN	469.0000	1.4000	TRP
JE	N*	440.0000	1.3710	"ADE,GUA"
JE	NB	529.0000	1.3040	"ADE,GUA"
JF	NB	410.0000	1.3940	"ADE,GUA,HIS"
JG	NA	427.0000	1.3810	"TRP,HIS"
JI	NC	502.0000	1.3240	ADE
JJ	CM	560.0000	1.3430	THY
JJ	JJ	549.0000	1.3500	"URA,CYT"
JJ	N*	448.0000	1.3650	"URA,CYT"
JK	HK	340.0000	1.0800	"TYR,PHE  OPLS (JTR 6-29-89)"
JK	JK	469.0000	1.4000	"TRP,TYR,PHE OPLS (JTR 6-29-89)"
JK	JN	469.0000	1.4000	TRP OPLS (JTR 10-22-90)
JK	NA	422.0000	1.3850	HIS   OPLS (JTR 10-22-90)
JK	NB	488.0000	1.3350	HIS(MOD) OPLS (JTR 10-22-90)
JN	NA	428.0000	1.3800	TRP
JP	NA	477.0000	1.3430	HIS
JP	NB	488.0000	1.3350	HIS(MOD)
JQ	JQ	260.0000	1.5260	AA(OL) OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	JV	260.0000	1.5260	ILE(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	JW	260.0000	1.5260	ILE(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	JZ	260.0000	1.5260	"AA,SUG   OPLS (JTR 12/11/85)"
JQ	N	337.0000	1.4490	GLY(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	N3	367.0000	1.4710	LYS(OL) OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	NT	367.0000	1.4710	GLY   OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	OH	386.0000	1.4250	"SUG(OL),SER  OPLS (JTR 12-11-85)"
JQ	OS	320.0000	1.4250	SUG(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	S	222.0000	1.8100	CYX(OL)   OPLS (JTR 12-11-85)
JQ	SH	222.0000	1.8100	CYS(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JV	JZ	260.0000	1.5260	ALA   OPLS (JTR 12/11/85)
JV	N	337.0000	1.4490	TEST!!!!
JV	N*	337.0000	1.4750	9 methyl bases
JV	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JV	N3	367.0000	1.4710	OPLS (JTR 12-11-85)
JV	OH	386.0000	1.4250	"SUG(OL),SER OPLS (JTR 12-11-85)"
JV	OS	320.0000	1.4250	DMP
JV	S	222.0000	1.8100	MET(OL)
JV	SH	222.0000	1.8100	CYS(OL)
JW	JZ	260.0000	1.5260	ALA   OPLS (JTR 12/11/85)
JW	N	337.0000	1.4490	TEST!!!!
JW	N*	337.0000	1.4750	9 methyl bases
JW	N2	337.0000	1.4630	ARG(OL)  OPLS (JTR 12-11-85)
JW	N3	367.0000	1.4710	OPLS (JTR 12-11-85)
JW	OH	386.0000	1.4250	"SUG(OL),SER OPLS (JTR 12-11-85)"
JW	OS	320.0000	1.4250	DMP
JW	S	222.0000	1.8100	MET(OL)
JW	SH	222.0000	1.8100	CYS(OL)
JX	JY	450.0000	1.3500	HEME
JZ	JZ	260.0000	1.5260	"SUG(as in CH-C2),ILE  OPLS (JTR 12/11/85)"
JZ	N	337.0000	1.4490	AA    OPLS (JTR 12/11/85)
JZ	N*	337.0000	1.4750	"ADE,GUA,CYT,URA  OPLS (JTR 12/11/85)"
JZ	N3	367.0000	1.4710	LYS(OL)    OPLS (JTR 12/11/85)
JZ	NT	367.0000	1.4710	AA      OPLS (JTR 12/11/85)
JZ	OH	386.0000	1.4250	"RSUG,THR   OPLS (JTR 12/11/85)"
JZ	OS	320.0000	1.4250	SUG      OPLS (JTR 12/11/85)
LP	S	600.0000	0.6790	
LP	SH	600.0000	0.6790	
M4	O4	6000.0000	0.1500	TIP4P MODEL OPLS (JTR 12-11-85)
O2	P	525.0000	1.4800	SUG(OL)
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S	S	166.0000	2.0380	CYX(OL)  SCHERAGA
