A1	A2	A3	KTHETA	THETAEQ	REFERENCE
HW	OW	HW	100.0000	104.5200	
HC	C*	CW	35.0000	126.8000	
HC	C*	CB	35.0000	126.8000	
C2	C	N	70.0000	116.6000	GLY             GELIN
C2	C	O	80.0000	120.4000	ASN(OL)         GELIN
C2	C	O2	70.0000	117.0000	"GLU(OL)          SCH JPC 79,2379"
C3	C	N	70.0000	116.6000	ACET(OL)        BENEDETTI
C3	C	O	80.0000	120.4000	ACET(OL)
C3	C	O2	70.0000	117.0000	"GLU(OL)          SCH JPC 79,2379"
CA	C	CA	85.0000	120.0000	TYR(OL)         GELIN
CA	C	OH	70.0000	120.0000	TYR(OL)        GELIN
CB	C	NA	70.0000	111.3000	GUA
CB	C	O	80.0000	128.8000	GUA
CD	C	CD	85.0000	120.0000	TYR(OL)         GELIN
CD	C	OH	70.0000	120.0000	TYR(OL)        GELIN
CH	C	N	70.0000	116.6000	AA(OL)
CH	C	O	80.0000	120.4000	AA(OL)
CH	C	O2	65.0000	117.0000	"AA(OL)          SCH JPC 79,2379"
CH	C	OH	70.0000	115.0000	"ACID(OL)        SCH JPC 79,2379"
CJ	C	NA	70.0000	114.1000	URA
CJ	C	O	80.0000	125.3000	URA
CM	C	NA	70.0000	114.1000	THY
CM	C	O	80.0000	125.3000	THY
CT	C	N	70.0000	116.6000	
CT	C	O	80.0000	120.4000	
CT	C	O2	70.0000	117.0000	"GLU(OL)          SCH JPC 79,2379"
N	C	O	80.0000	122.9000	AA(OL)
N*	C	NA	70.0000	115.4000	URA
N*	C	NC	70.0000	118.6000	CYT
N*	C	O	80.0000	120.9000	"URA,CYT"
NA	C	O	80.0000	120.6000	"URA(2),GUA"
NC	C	O	80.0000	122.5000	CYT
O	C	O	80.0000	126.0000	COO- terminal residues
O2	C	O2	80.0000	126.0000	"GLU(OL)      SCH JPC 79,2379"
C2	C*	CB	70.0000	128.6000	TRP(OL)
C2	C*	CG	70.0000	125.0000	TRP(OL)
C2	C*	CW	70.0000	125.0000	TRP(OL)
CB	C*	CG	85.0000	106.4000	TRP(OL)
CB	C*	CT	70.0000	128.6000	TRP(OL)
CB	C*	CW	85.0000	106.4000	TRP(OL)
CT	C*	CW	70.0000	125.0000	TRP(OL)
C	C2	C2	63.0000	112.4000	GLU
C	C2	CH	63.0000	112.4000	ASP
C	C2	N	80.0000	110.3000	GLY   WORK DONE ON 6/23/82
C	C2	NT	80.0000	111.2000	"GLY   JCP 76, 1439"
C*	C2	CH	63.0000	115.6000	TRP(OL)
C2	C2	C2	63.0000	112.4000	"PRO,LYS"
C2	C2	CH	63.0000	112.4000	MET
C2	C2	N	80.0000	111.2000	"PRO   JCP 76, 1439"
C2	C2	N2	80.0000	111.2000	"ARG   JCP 76, 1439"
C2	C2	N3	80.0000	111.2000	"LYS(OL)   JCP 76, 1439"
C2	C2	NT	80.0000	111.2000	"PRO   JCP 76, 1439"
C2	C2	OS	80.0000	109.5000	THF fit
C2	C2	S	50.0000	114.7000	"MET            SCHERAGA  JPC 79,1428"
C3	C2	CH	63.0000	112.4000	ILE
C3	C2	OS	80.0000	109.5000	MEE
CA	C2	CH	63.0000	114.0000	"PHE(OL)         SCH JPC  79,2379"
CC	C2	CH	63.0000	113.1000	HIS(OL)
CH	C2	CH	63.0000	112.4000	"SUG,LEU"
CH	C2	OH	80.0000	109.5000	"SER,end sugar"
CH	C2	OS	80.0000	109.5000	SUG
CH	C2	S	50.0000	114.7000	"CYX            SCHERAGA  JPC 79,1428"
CH	C2	SH	50.0000	108.6000	CYS
C	CA	CA	85.0000	120.0000	TYR(OL)
C	CA	HC	35.0000	120.0000	
C2	CA	CA	70.0000	120.0000	PHE(OL)
C2	CA	CD	70.0000	120.0000	PHE(OL)
CA	CA	CA	85.0000	120.0000	PHE(OL)
CA	CA	CB	85.0000	120.0000	TRP(OL)
CA	CA	CN	85.0000	120.0000	TRP(OL)
CA	CA	CT	70.0000	120.0000	PHE(OL)
CA	CA	HC	35.0000	120.0000	
CB	CA	HC	35.0000	120.0000	
CB	CA	N2	70.0000	123.5000	ADE
CB	CA	NC	70.0000	117.3000	ADE
CD	CA	CD	85.0000	120.0000	PHE(OL)
CJ	CA	N2	70.0000	120.1000	CYT
CJ	CA	NC	70.0000	121.5000	CYT
CM	CA	N2	70.0000	120.1000	
CM	CA	NC	70.0000	121.5000	
CN	CA	HC	35.0000	120.0000	
N2	CA	N2	70.0000	120.0000	ARG(OL)
N2	CA	NA	70.0000	116.0000	GUA
N2	CA	NC	70.0000	119.3000	"ADE,GUA"
NA	CA	NC	70.0000	123.3000	GUA
C	CB	CB	85.0000	119.2000	GUA
C	CB	NB	70.0000	130.0000	GUA
C*	CB	CA	85.0000	134.9000	TRP(OL)
C*	CB	CD	85.0000	134.9000	TRP(OL)
C*	CB	CN	85.0000	108.8000	TRP(OL)
CA	CB	CB	85.0000	117.3000	ADE
CA	CB	CN	85.0000	116.2000	TRP
CA	CB	NB	70.0000	132.4000	ADE
CB	CB	N*	70.0000	106.2000	"GUA,ADE"
CB	CB	NB	70.0000	110.4000	"GUA,ADE"
CB	CB	NC	70.0000	127.7000	"GUA,ADE"
CD	CB	CN	85.0000	116.2000	TRP
N*	CB	NC	70.0000	126.2000	"GUA,ADE"
C2	CC	CF	70.0000	131.9000	HIS(OL)
C2	CC	CG	70.0000	129.0500	HIS(OL)
C2	CC	CV	70.0000	131.9000	HIS(OL)
C2	CC	CW	70.0000	129.0500	HIS(OL)
C2	CC	NA	70.0000	122.2000	HIS(OL)
C2	CC	NB	70.0000	121.0500	HIS(OL)
CF	CC	NA	70.0000	105.9000	HIS(OL)
CG	CC	NA	70.0000	108.7500	HIS(OL)
CG	CC	NB	70.0000	109.9000	HIS(OL)
CT	CC	CV	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CT	CC	CW	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CT	CC	NA	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CT	CC	NB	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CV	CC	NA	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CW	CC	NA	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CW	CC	NB	70.0000	120.0000	HIS(OL)
C	CD	CD	85.0000	120.0000	TYR(OL)
CA	CD	CD	85.0000	120.0000	PHE
CB	CD	CD	85.0000	120.0000	TRP(OL)
CD	CD	CD	85.0000	120.0000	PHE(OL)
CD	CD	CN	85.0000	120.0000	TRP(OL)
N*	CE	NB	70.0000	113.9000	"ADE,GUA"
CC	CF	NB	70.0000	109.9000	HIS(OL)
C*	CG	NA	70.0000	108.7000	TRP(OL)
CC	CG	NA	70.0000	105.9000	HIS(OL)
C	CH	C2	63.0000	111.1000	AA
C	CH	C3	63.0000	111.1000	ALA
C	CH	CH	63.0000	111.1000	ILE
C	CH	N	63.0000	110.1000	AA     WORK DONE ON 6/23/82
C	CH	NT	80.0000	109.7000	AA
C2	CH	C3	63.0000	111.5000	LEU
C2	CH	CH	63.0000	111.5000	"SUG,ILE"
C2	CH	N	80.0000	109.7000	"ALA    JACS 94, 2657"
C2	CH	N*	80.0000	109.5000	SUG
C2	CH	NT	80.0000	109.7000	AA
C2	CH	OH	80.0000	109.5000	SUG (END GROUP)
C2	CH	OS	80.0000	109.5000	SUG
C3	CH	C3	63.0000	111.5000	VAL
C3	CH	CH	63.0000	111.5000	ILE
C3	CH	N	80.0000	109.5000	**
C3	CH	NT	80.0000	109.7000	AA
C3	CH	OH	80.0000	109.5000	THR
CH	CH	CH	63.0000	111.5000	SUG
CH	CH	N	80.0000	109.7000	"ILE    JACS 94, 2657"
CH	CH	N*	80.0000	109.5000	SUG
CH	CH	NT	80.0000	109.7000	AA
CH	CH	OH	80.0000	109.5000	"THR,end sugar"
CH	CH	OS	80.0000	109.5000	SUG
N*	CH	OS	80.0000	109.5000	SUG
NC	CI	NC	70.0000	129.1000	ADE
C	CJ	CJ	85.0000	120.7000	URA
CA	CJ	CJ	85.0000	117.0000	CYT
CJ	CJ	N*	70.0000	121.2000	CYT
CM	CJ	N*	70.0000	121.2000	THY
HC	CK	N*	35.0000	123.0500	
HC	CK	NB	35.0000	123.0500	
N*	CK	NB	70.0000	113.9000	
C	CM	C3	85.0000	119.7000	THY
C	CM	CJ	85.0000	120.7000	THY
C	CM	CM	85.0000	120.7000	
C	CM	CT	70.0000	119.7000	
C	CM	HC	35.0000	119.7000	
C3	CM	CJ	85.0000	119.7000	THY
CA	CM	CM	85.0000	117.0000	
CA	CM	HC	35.0000	123.3000	
CJ	CM	CT	85.0000	119.7000	
CM	CM	CT	70.0000	119.7000	
CM	CM	HC	35.0000	119.7000	
CM	CM	N*	70.0000	121.2000	
HC	CM	N*	35.0000	119.1000	
CA	CN	CB	85.0000	122.7000	TRP
CA	CN	NA	70.0000	132.8000	TRP(OL)
CB	CN	CD	85.0000	122.7000	TRP
CB	CN	NA	70.0000	104.4000	
CD	CN	NA	70.0000	132.8000	TRP(OL)
NA	CP	NA	70.0000	110.7500	HISP(OL)
NA	CP	NB	70.0000	111.6000	HIS(OL)
HC	CQ	NC	35.0000	115.4500	
NC	CQ	NC	70.0000	129.1000	
HC	CR	NA	35.0000	120.0000	
HC	CR	NB	35.0000	120.0000	
NA	CR	NA	70.0000	120.0000	HISP(OL)
NA	CR	NB	70.0000	120.0000	HIS(OL)
C	CT	CT	63.0000	111.1000	AA
C	CT	HC	35.0000	109.5000	
C	CT	N	63.0000	110.1000	AA     WORK DONE ON 6/23/82
C*	CT	CT	63.0000	115.6000	TRP(OL)
C*	CT	HC	35.0000	109.5000	
CA	CT	CT	63.0000	114.0000	"PHE(OL)         SCH JPC  79,2379"
CA	CT	HC	35.0000	109.5000	
CC	CT	CT	63.0000	113.1000	HIS(OL)
CC	CT	HC	35.0000	109.5000	
CM	CT	HC	35.0000	109.5000	
CT	CT	CT	40.0000	109.5000	
CT	CT	HC	35.0000	109.5000	
CT	CT	N	80.0000	109.7000	"ALA    JACS 94, 2657"
CT	CT	N*	50.0000	109.5000	
CT	CT	N2	80.0000	111.2000	"ARG   JCP 76, 1439"
C	CT	N3	80.0000	111.2000	Amino terminal residues
CT	CT	N3	80.0000	111.2000	"LYS(OL)   JCP 76, 1439"
CT	CT	OH	50.0000	109.5000	
CT	CT	OS	50.0000	109.5000	
CT	CT	S	50.0000	114.7000	"CYX            SCHERAGA  JPC 79,1428"
CT	CT	SH	50.0000	108.6000	CYS
HC	CT	HC	35.0000	109.5000	
HC	CT	N	35.0000	109.5000	
HC	CT	N*	35.0000	109.5000	
HC	CT	N2	35.0000	109.5000	
HC	CT	N3	35.0000	109.5000	
HC	CT	OH	35.0000	109.5000	
HC	CT	OS	35.0000	109.5000	SUG
HC	CT	S	35.0000	109.5000	
HC	CT	SH	35.0000	109.5000	
N*	CT	OS	50.0000	109.5000	
CC	CV	HC	35.0000	120.0000	
CC	CV	NB	70.0000	120.0000	HIS(OL)
HC	CV	NB	35.0000	120.0000	
C*	CW	HC	35.0000	120.0000	
C*	CW	NA	70.0000	108.7000	TRP(OL)
CC	CW	HC	35.0000	120.0000	
CC	CW	NA	70.0000	120.0000	HIS(OL)
HC	CW	NA	35.0000	120.0000	
C	N	C2	50.0000	121.9000	PRO(OL)
C	N	C3	50.0000	121.9000	TEST!!!!!!!!
C	N	CH	50.0000	121.9000	AA(OL)
C	N	CT	50.0000	121.9000	
C	N	H	35.0000	119.8000	AA(OL)
C	N	H2	35.0000	120.0000	"GLN,ASN                 **"
C2	N	CH	50.0000	118.0000	"PRO(OL)         DETAR JACS 99,1232"
C2	N	H	38.0000	118.4000	AA(OL)
C3	N	H	38.0000	118.4000	TEST!!!!!!!
CH	N	H	38.0000	118.4000	AA(OL)
CT	N	CT	50.0000	118.0000	"PRO(OL)         DETAR JACS 99,1232"
CT	N	H	38.0000	118.4000	
H	N	H	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,GLN,ASN     **"
H3	N	H3	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,GLN,ASN     **"
C	N*	CH	70.0000	117.6000	"URA,CYT"
C	N*	CJ	70.0000	121.6000	"URA,CYT"
C	N*	CM	70.0000	121.6000	
C	N*	CT	70.0000	117.6000	
C	N*	H	35.0000	119.2000	
C3	N*	CB	70.0000	125.8000	"9 methylated guan,aden"
C3	N*	CE	70.0000	128.8000	Methylated purines
C3	N*	CK	70.0000	128.8000	
CB	N*	CE	70.0000	105.4000	"GUA,ADE"
CB	N*	CH	70.0000	125.8000	"GUA,ADE"
CB	N*	CK	70.0000	105.4000	
CB	N*	CT	70.0000	125.8000	
CB	N*	H	35.0000	127.3000	
CE	N*	CH	70.0000	128.8000	"GUA,ADE"
CE	N*	CT	70.0000	128.8000	
CE	N*	H	35.0000	127.3000	
CH	N*	CJ	70.0000	121.2000	"URA,CYT"
CH	N*	CK	70.0000	128.8000	
CJ	N*	CT	70.0000	121.2000	
CJ	N*	H	35.0000	119.2000	
CK	N*	CT	70.0000	128.8000	
CM	N*	CT	70.0000	121.2000	
CM	N*	H	35.0000	119.2000	
C2	N2	CA	50.0000	123.2000	ARG(OL)
C2	N2	H2	35.0000	118.4000	ARG(OL)
C2	N2	H3	35.0000	118.4000	ARG(OL)
C3	N2	CA	50.0000	123.2000	ARG(OL)
C3	N2	H2	35.0000	118.4000	ARG(OL)
CA	N2	CT	50.0000	123.2000	ARG(OL)
CA	N2	H	35.0000	120.0000	ARG(OL)
CA	N2	H2	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,ARG"
CA	N2	H3	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,ARG"
CT	N2	H3	35.0000	118.4000	ARG(OL)
H2	N2	H2	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,GLN,ASN,ARG"
H3	N2	H3	35.0000	120.0000	"ADE,CYT,GUA,GLN,ASN,ARG"
C2	N3	H3	35.0000	109.5000	LYS
C3	N3	H3	35.0000	109.5000	
CT	N3	H3	35.0000	109.5000	LYS
H3	N3	H3	35.0000	109.5000	LYS
CT	N3	CT	50.0000	113.0000	proline j.phys chem 1979 p 2361
C	NA	C	70.0000	126.4000	URA
C	NA	CA	70.0000	125.2000	GUA
C	NA	H	35.0000	116.8000	"GUA,URA(2)"
CA	NA	H	35.0000	118.0000	GUA
CC	NA	CP	70.0000	107.3000	HIS(OL)
CC	NA	CR	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CC	NA	H	35.0000	120.0000	HIS(OL)
CG	NA	CN	70.0000	111.6000	TRP(OL)
CG	NA	CP	70.0000	107.3000	HIS(OL)
CG	NA	CR	70.0000	107.3000	HIS(OL)
CG	NA	H	35.0000	126.3500	HIS(OL)
CN	NA	CW	70.0000	111.6000	TRP(OL)
CN	NA	H	35.0000	123.1000	TRP
CP	NA	H	35.0000	126.3500	HIS(OL)
CR	NA	CW	70.0000	120.0000	HIS(OL)
CR	NA	H	35.0000	120.0000	HIS(OL)
CW	NA	H	35.0000	120.0000	HIS(OL)
CB	NB	CE	70.0000	103.8000	"GUA,ADE"
CB	NB	CK	70.0000	103.8000	
CC	NB	CP	70.0000	105.3000	HIS(OL)
CC	NB	CR	70.0000	117.0000	HIS(OL)
CF	NB	CP	70.0000	105.3000	HIS(OL)
CF	NB	CR	70.0000	105.3000	HIS(OL)
CR	NB	CV	70.0000	117.0000	HIS(OL)
C	NC	CA	70.0000	120.5000	CYT
CA	NC	CB	70.0000	112.2000	GUA
CA	NC	CI	70.0000	118.6000	ADE
CA	NC	CQ	70.0000	118.6000	
CB	NC	CI	70.0000	111.0000	ADE
CB	NC	CQ	70.0000	111.0000	
C2	NT	H2	35.0000	109.5000	AA
CH	NT	H2	35.0000	109.5000	GLY
H2	NT	H2	35.0000	109.5000	AA(END)
C	OH	HO	35.0000	113.0000	TYR(PHENOL)     HARMONY MEOH
C2	OH	HO	55.0000	108.5000	"SUG,SER(OL,mod)"
C3	OH	HO	55.0000	108.5000	"SUG,SER(OL,mod)"
CH	OH	HO	55.0000	108.5000	"THR(OL),SUG"
CT	OH	HO	55.0000	108.5000	! End of SJW input for CT types
HO	OH	HO	47.0000	104.5000	
HO	OH	P	45.0000	108.5000	SUG(OL)
C2	OS	C2	100.0000	111.8000	DME based
C2	OS	C3	100.0000	111.8000	DME based
C2	OS	HO	55.0000	108.5000	SUG
C2	OS	P	100.0000	120.5000	SUG(OL)
C3	OS	P	100.0000	120.5000	DMPhos based
CH	OS	CH	100.0000	111.8000	SUG(dme based)
CH	OS	HO	55.0000	108.5000	SUG
CH	OS	P	100.0000	120.5000	SUG
CT	OS	CT	60.0000	109.5000	
CT	OS	P	100.0000	120.5000	
O	C	O2	80.0000	126.0000	adk
O2	P	O2	140.0000	119.9000	SUG(OL)
O2	P	OH	45.0000	108.2300	SUG(OL)
O2	P	OS	100.0000	108.2300	SUG(OL)
OH	P	OS	45.0000	102.6000	SUG(OL)
OS	P	OS	45.0000	102.6000	SUG(OL)
C2	S	C3	62.0000	98.9000	MET(OL)
C2	S	LP	150.0000	96.7000	
C2	S	S	68.0000	103.7000	"CYX(OL)        SCHERAGA  JPC 79,1428"
C3	S	LP	150.0000	96.7000	
C3	S	S	68.0000	103.7000	"CYX(OL)        SCHERAGA  JPC 79,1428"
CT	S	CT	62.0000	98.9000	MET(OL)
CT	S	LP	150.0000	96.7000	
CT	S	S	68.0000	103.7000	"CYX(OL)        SCHERAGA  JPC 79,1428"
LP	S	LP	0.0000	160.0000	
LP	S	S	150.0000	96.7000	
C2	SH	HS	44.0000	96.0000	CYS(OL)
C2	SH	LP	150.0000	96.7000	
C3	SH	HS	44.0000	96.0000	CYS(OL)
C3	SH	LP	150.0000	96.7000	
CT	SH	HS	44.0000	96.0000	CYS(OL)
CT	SH	LP	150.0000	96.7000	
HS	SH	HS	35.0000	92.0700	
HS	SH	LP	150.0000	96.7000	
LP	SH	LP	0.0000	160.0000	
P	OS	P	100.0000	120.5000	
C	CH	N3	63.0000	110.1000	AA     WORK DONE ON 6/23/82 (from parmuni.dat)
C2	C	OH	50.0000	115.0000	DOHE END GROUP FOR PROTEINS (from parmuni.dat)
C2	C2	CB	46.5000	112.0000	HEME (from parmuni.dat)
C2	CB	CB	70.0000	126.5000	HEME (from parmuni.dat)
C2	CB	CC	70.0000	126.5000	HEME (from parmuni.dat)
C2	CH	N3	80.0000	109.7000	AA     by analogy to NT-CH-C2 (from parmuni.dat)
C3	CB	CB	70.0000	126.5000	HEME (from parmuni.dat)
C3	CB	CC	70.0000	126.5000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CB	CC	80.0000	107.0000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CB	CY	70.0000	120.0000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CC	CD	70.0000	124.2000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CC	NO	70.0000	110.3000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CC	NP	70.0000	110.3000	HEME (from parmuni.dat)
CB	CY	CX	50.0000	120.0000	HEME (from parmuni.dat)
CC	CB	CY	70.0000	120.0000	END OF HEME ANGLES (from parmuni.dat)
CC	CD	CC	70.0000	124.4000	HEME (from parmuni.dat)
CC	NO	CC	50.0000	105.4000	HEME (from parmuni.dat)
CC	NO	FE	50.0000	127.3000	HEME (from parmuni.dat)
CC	NP	CC	50.0000	105.4000	HEME (from parmuni.dat)
CC	NP	FE	50.0000	127.3000	HEME (from parmuni.dat)
CD	CC	NO	70.0000	125.5000	HEME (from parmuni.dat)
CD	CC	NP	70.0000	125.5000	HEME (from parmuni.dat)
CF	NB	FE	130.0000	124.8000	HEME (from parmuni.dat)
CH	CH	N3	80.0000	111.2000	"LYS(OL)   JCP 76, 1439 (from parmuni.dat)"
CH	N3	H3	35.0000	109.5000	LYS (from parmuni.dat)
CP	NB	FE	130.0000	124.8000	HEME (from parmuni.dat)
NB	FE	NB	0.0000	180.0000	HEME (from parmuni.dat)
NB	FE	NO	55.0000	90.0000	HEME (from parmuni.dat)
NB	FE	NP	55.0000	90.0000	HEME (from parmuni.dat)
NB	FE	W	30.0000	180.0000	HEME (from parmuni.dat)
NO	FE	NO	0.0000	180.0000	HEME (from parmuni.dat)
NO	FE	NP	55.0000	90.0000	HEME (from parmuni.dat)
NO	FE	W	30.0000	90.0000	HEME (from parmuni.dat)
NP	FE	NP	0.0000	180.0000	HEME (from parmuni.dat)
NP	FE	W	30.0000	90.0000	HEME (from parmuni.dat)
O	C	OH	80.0000	126.0000	DOHE END GROUP FOR PROTEINS (from parmuni.dat)
